Автор: Майкл Хедерле
Загадка пандемии
Ученые UNM хотят знать, почему некоторые группы испытывают более серьезные симптомы COVID-19
В мае 2020 года по мере роста числа пациентов с COVID-19 Будучи госпитализированным в больницу Университета Нью-Мексико, DJ Perkins и его коллеги начали исследование, чтобы попытаться выяснить, почему одни пациенты заболели намного хуже, чем другие.
У каждого пациента, включенного в исследование, брали мазки из носа или носоглотки в семь разных дней в течение двухнедельного периода для измерения вирусной нагрузки в верхних дыхательных путях. В каждом случае также брали образец крови и анализировали на наличие вируса и иммунный ответ.
Теперь, после включения 365 пациентов (и их количество продолжает расти), исследование получило грант в размере 2.3 миллиона долларов от Национального института аллергии и инфекционных заболеваний - и это более пристальное внимание.
«Одна из вещей, которые мы наблюдали у наших госпитализированных пациентов, - это чрезмерная представленность пациентов, которые были американскими индейцами / коренными жителями Аляски», - сказал Перкинс, профессор и директор Центра глобального здравоохранения Медицинской школы UNM. «Это действительно стало эпицентром гранта. . . выяснить, как разные группы предков в Нью-Мексико реагируют на вирус и как это влияет на тяжесть их болезни ».
По словам Перкинса, в UNMH, который занимается лечением пациентов со всего региона Четырех углов, 47% пациентов с COVID-19, включенных в исследование, были американскими индейцами / коренными жителями Аляски. А в Нью-Мексико, с поправкой на размер населения, у них риск заражения в 3.3 раза, частота госпитализаций в 7.9 раза выше, а смертность с поправкой на возраст в 10.6 раза.
Некоторые пациенты в исследовании выздоравливали так быстро, что их выписали до истечения 14-дневного периода сбора данных, сказал Перкинс, в то время как другие оставались в больнице дольше, а некоторые скончались от болезни.
У нас есть уникальные возможности для устранения важных пробелов в знаниях о молекулярных основах повышенной тяжести заболевания и смертности от COVID-19 в непропорционально пораженных группах предков.
По словам Перкинса, этническое и расовое разнообразие Нью-Мексико дает определенные преимущества для исследования. «У нас есть уникальные возможности для устранения важных пробелов в знаниях о молекулярной основе повышенной тяжести заболевания и смертности от COVID-19 в непропорционально пораженных группах предков».
Взятие нескольких образцов с течением времени позволило исследователям нарисовать картину динамики вирусной нагрузки - скорости и эффективности, с которой организм реагирует на вирусную инфекцию. По словам Перкинса, команда надеется, что дальнейший анализ покажет, какие гены подвергают людей большему риску серьезных заболеваний.
Каждый образец крови, взятый в ходе исследования, был проанализирован на предмет его транскриптома - считывания РНК экспрессируемых генов. «Это позволяет нам посмотреть, как вирусные нагрузки, как в верхних дыхательных путях, так и в циркулирующей крови, влияют на иммунный ответ», - сказал Перкинс.
«Мы используем программные алгоритмы, чтобы поместить те гены, которые по-разному экспрессируются в разные информационные конвейеры, чтобы вы могли найти сигналы, которые различаются для тяжелого и нетяжелого заболевания», - сказал он. «Как только вы определите эти сигналы, они станут терапевтическими целями для новых методов лечения COVID-19».
Поскольку анализ показывает эти уникальные генные пути, ведущие к тяжелым заболеваниям, «затем вы можете пойти и поискать одобренные FDA лекарства от других заболеваний, которые могут быть нацелены на эти гены и генные сети», - сказал он.
По словам Перкинса, создание более четкой картины того, кто подвергается наибольшему риску тяжелого заболевания, и сбор данных для подсказок относительно возможных методов лечения, имеют свои собственные выгоды. «Я надеюсь, что мы сможем оказать положительное влияние на проблемы COVID-19 в Нью-Мексико».