Прогностическая ценность и паттерны коэкспрессии метаболических путей при раке

Дэн Чжан, Ян Го и Ни Се | 29 декабря 2020
проверка данных : Аномальные метаболические пути считаются одним из признаков рака. Пока
многочисленные метаболические пути были изучены при различных видах рака, прямая связь между метаболическими путями
экспрессия генов и прогноз рака не установлены.
Итоги: Используя два недавно разработанных метода анализа биоинформатики, мы оценили прогностический потенциал
экспрессия метаболических путей и нарушение регуляции опухолью по сравнению с нормой для 29 метаболических путей при 33 видах рака
типы. Результаты показывают, что повышенная экспрессия метаболических генов в опухолях соответствует плохому прогнозу рака.
Анализ метадифференциальной коэкспрессии выявил четыре метаболических пути со значительной глобальной коэкспрессией.
нарушение сети между опухолевыми и нормальными образцами. Анализ дифференциальной экспрессии метаболических путей
также продемонстрировали сильное нарушение экспрессии генов между парными опухолевыми и нормальными образцами.
Заключение: Взятые вместе, эти результаты убедительно свидетельствуют о том, что экспрессия генов метаболических путей
нарушается после онкогенеза. В опухолях активируются многие метаболические пути для активации опухолевых клеток.
соответствующий метаболизм для поддержания необходимой энергии для клеточного деления.
Ключевые слова: Метаболический путь, анализ коэкспрессии мета, составная оценка экспрессии генов, рак

Глобальная аутозиготность связана с риском рака, мутационной сигнатурой и прогнозом

Лиминь Цзян, Фей Го, Цзицзюнь Тан, Шугуань Ленг, Скотт Несс, Фей Е, Хуинин Кан, Дэвид С. Сэмюэлс и Ян Го | 04 декабря 2020
Глобальная аутозиготность в виде серий гомозиготности связана с различными заболеваниями. Коэффициент гетерозиготности, альтернативный показатель общей аутозиготности, используется для оценки риска рака в этом исследовании. Наш анализ показывает сильную и последовательную связь между коэффициентами гетерозиготности и различными типами рака. Дальнейший анализ показывает потенциальную связь отношения гетерозиготности с мутационными сигнатурами и прогнозом рака.